La iglesia de Cuicuno tiene una nave central y esta cruzada por una nave lateral a la altura del atrio. En ese sitio se edificó la iglesia alrededor de la imagen. El santuario es visitado por fieles de todo el país y tiene cierta vinculación con San Gonzalo de la Capilla de la Medalla Milagrosa en Ambato. Relación en la cual la religiosidad popular e incluso el paganismo se presenta.
La difusión de la advocación al Señor del Árbol de Cuicuno es un fenómeno que se incrementa día a día, en el ámbito provisional con énfasis de los creyentes de la región interandina.

Este árbol está asociado con los ancestros nativos, es decir los mallqui. Los que a su vez tienen relación con la celebración nativa de Difuntos. Señala la tradición que sobre 1670 se procedió a cortar un árbol de quishwar o conocido también como el Árbol de Dios y para asombro de fieles y clérigos, se encontró una figura de Cristo.
Este es el origen de la devoción al Señor del Árbol de Cuicuno.

Este Santuario se edificó en el siglo XVI, y perteneció a la familia Rovayo. En el mismo sitio un indio de Guápulo(Quito) compro a la misma familia dos “caballerizas” (medida de área española), para sembrar allí el árbol de “Quishwar”, también conocido como árbol de Dios. Este árbol está asociado con los ancestros nativos, es decir los Mallqui. Los que a su vez tienen relación con la celebración nativa de difuntos.
Ubicación
El Santuario de Cuicuno se encuentra ubicado a 13 kilómetros del cantón Saquisilí.